Инженеры Honda уверены, что лучшая авария - это авария, которой удалось избежать. Именно поэтому Civic 5D был оснащен пакетом электронных систем безопасности, которые придут на помощь водителю в самой сложной дорожной ситуации. Но иногда аварии все же происходят и здесь решающую роль играет так называемая пассивная безопасность. В первую очередь это сам кузов автомобиля, выполненный из высокопрочной стали. Среди элементом защиты: специальные кресла, которые гасят удар, ремни безопасности с преднатяжением, подголовники, предотвращающие опасные травмы позвоночника, кроме того салон оснащен подушками и шторками безопасности. Специально для детской безопасности Civic 5D имеет систему креплений детских кресел ISOFix, позволяющую в одно мгновение зафиксировать кресло с ребенком.